隨著科學技術的發展，很多傳統學科得到發展，延伸出很多新的方向，并且不同學科間相互融合，產生了一些新的學科——交叉學科。例如工程管理（涉及工程學與管理學）、生物信息學（涉及生物學與計算機科學）。如今，交叉學科、邊緣學科及跨學科的科學研究也成為世界科學技術取得突破性進展的新的增長點。如何培養這種復合型的研究人才，是當今高校研究生教育面臨的一個重大課題，交叉學科碩士論文寫作也被廣泛關注。今天我們主要探討交叉學科碩士論文選題問題。
一、交叉學科碩士論文選題的特點
專業性。交叉學科碩士研究生大多都是在原有專業的基礎上與相鄰學科或者相近領域學科進行交叉培養的，所以在碩士論文的選題上如果不注意很容易偏離自己本來的專業，這就要求碩士論文在專業性與交叉性中把握好分寸，要在自己專業的基礎上，充分發揮交叉學科的優勢，突出選題的專業性。
綜合性。既然是交叉學科，必然在培養研究生的過程中需要交叉學科知識的你來我往，如果過于局限于自己本專業來進行選題，那就不能突出是交叉學科了，所以必然要求論文的選題要有一定綜合性。另外，由于不同學科研究方法、研究手段的不同，所以在進行論文選題的過程中，搜索資料、篩選資料、提煉觀點的方法也不盡相同，所以論文選題的來源和方式也具有綜合性的特點。
多面性。交叉學科碩士論文選題往往從兩個或多個學科相交重疊部分入手，進而發現研究領域，正是因為這樣，所以研究的問題和對象往往具有一定的復雜性，不能從單一的角度或方面來論述，其選題的意義和可行性都涉及多方面的內容。
學科間交叉的切入點是關鍵。交叉學科碩士論文要有好的選題，必須找好交叉學科間的切入點，找準切入點是選好題、寫好論文的基礎和關鍵，也是考察研究生學習期間綜合運用交叉學科知識的方式之一。
二、交叉學科碩士論文選題的來源
交叉學科碩士論文選題主要有三個來源：
首先，來自他人的研究和建議。當研究生不知道研究什么主題時，可以參閱相關的學術著作和他人已經發表的學術論文，既要看自己本專業的，還要看相鄰學科、交叉學科領域的，看別人都做了什么研究，已經取得了什么進展，是否還有需要進一步研究深化的問題。這就要求研究生大量地閱讀參考文獻。如果在論文選題之前并沒有進行系統的文獻檢索與閱讀，僅憑手頭的幾篇論文或書籍，或者僅憑自己的興趣和愛好，匆匆選題，這就容易重復他人研究。選題查新的好處在于可以積累相關的文獻資料，為后續的學位論文工作提供線索，做好準備工作，了解到本研究方向哪些是已經研究出的成果，已取得了哪些進展、還存在哪些不足和有待改進之處，從而在前人的工作基礎之上有所創新。
其次，來自他人或自己的實踐。偏重于理論研究的研究生可能較少考慮現實問題，但對于交叉學科的碩士論文來說，在選擇研究的主題時應該首先考慮社會實踐中遇到的問題，如果這些問題能夠通過運用交叉學科知識得到解決或緩解，那么就可以考慮將這些現實中的問題轉化為研究的主題。這里的實踐，可以是研究生自己的實踐活動，也可以是他人的實踐活動，而且后者往往是主要的。
第三，來自歷史上或現實中有爭議的問題。交叉學科中，由于受認識或研究條件的局限，大多數課題都可能存在這樣那樣的爭議。一些爭議準確地反映了學術前沿的現狀，所以可以利用這樣的爭議問題，找到選題的領域和靈感。
三、交叉學科碩士論文選題的方式
其實，這個問題就是，論文的選題是自己導師的課題還是自選的課題。由于交叉學科碩士論文選題具有自己的特點，所以很多交叉培養的研究生不好掌握學科間的結合程度，容易偏離自己本專業知識，這就需要導師的協助。導師獲準的基金項目及各種課題，都經歷過較嚴格的審查和選擇，具有較高的學術或應用水準，研究生從導師的課題中，選擇適合于自己特點或能力的題目來做碩士論文，無疑是一個較好的途徑。這樣的選題往往有較高的起點，容易做出較高學術水平的學位論文。所以，為了提高交叉學科碩士論文的質量，不妨把導師課題作為碩士生選題途徑之一。
但是，如果只依賴于導師的課題，就會由此影響研究生選題能力的提高，還需要有補救措施，那就是要給學生自主選擇的空間，只有這樣才能發現學生的研究興趣和閃光點，導師剛開始不要干涉太多，只要把握住大方向即可，所以應該將這兩種途徑結合起來，才能充分發揮交叉學科的優勢。
四、交叉學科碩士論文選題的目標
專業性和學科綜合性。交叉學科碩士論文的選題應該充分體現專業性和學科綜合性的結合，既有本專業的基礎理論，又有交叉學科的實踐應用，并且能體現出交叉學科間的切入點和結合點。
前瞻性。交叉學科碩士論文也應該有前瞻性，一個課題雖然有學術性，但如果在現代社會已經沒有地位，或者在現代社會中不會發生這樣的問題，這樣的研究沒有什么現實意義。進行交叉學科的研究就是為了運用多學科的知識和理論背景來分析問題、解決問題，問題的提出本身就具有前瞻性，所以好的交叉培養中的碩士論文必須具有前瞻性。
可行性。雖然是交叉學科的論文選題，但是不能為了體現“交叉”就硬性的把不想關的理論知識拼湊在一起，這樣文章既沒有價值，在聯系社會現實上又沒有可行性，所以要密切聯系社會實際，關注現實問題，讓選題具有可行性。
可持續性。交叉學科碩士論文還要具有可持續性，就是說論文選題要有一定的發展空間，具有一直拓展延伸的可能性，這才能做到“深”與“廣”的結合。
五、交叉學科碩士論文選題注意事項
材料的搜集。這是論文選題的基礎，對于交叉學科碩士論文選題而言尤為重要，是選好題、寫好論文的準備工作，所以應該在相關領域、交叉學課之間充分查閱資料，做好資料的分類和篩選，以備以后查閱。
題目的擬定。交叉學科碩士論文題目應該反映處交叉學科的特點，讓讀者看題目就可以明白這篇論文運用了交叉學科的知識，這就要找準學科之間交叉的切入點，把交叉學科很好的結合起來。
導師的意見。一般來說，交叉學科碩士研究生都會有兩個指導老師，在論文選題的過程中學生必然會征求指導老師的意見，但是有時因為指導老師的學科背景和知識結構不同而導致給學生的指導意見不同，這時學生就應該積極主動的多和老師溝通，及時把意見和研究內容反饋給老師，最重要的是，學生應該有自己的主見和觀點，對自己的研究興趣和領域以及選題有信心，只有這樣才能更多、更好的吸收老師的意見，做好論文的選題工作。